Хронична диария е тази, която продължава седмици и месеци. Най-често тя се дължи на недоимък на някои ензими, участващи в смилането на храната. В някои случаи причината е хронична чревна инфекция. Продължителната диария води до изтощаване на детето и до измършавяване, а в по-тежките случаи и до изоставане в растежа и развитието.
Целиакият а е заболяване, протичащо с хронична диария. Дължи се на непоносимост към храните, съдържащи пшеничено, овесено, ръжено или ечемичено брашно, по-точно към съставката глутен. Затова диарията се появява едва когато на децата започнат да се дават храни от пшеничено брашно - брашнена каша, бисквити, хляб, кремове, кисели, вафли и др. Де-цата, болни от целиакия, се изхождат не много често, само по 2-3 пъти на ден, но обилно, като количеството на изпражненията достига до 200-400 грама за денонощие, дори и повече. Поради увеличаване на чревното съдържимо коремчето на такова дете става голямо. Апетитът му е лош, капризен, то отслабва, измършавява. След като се изясни причината, лекарят назначава специална диета без храни от пшеничено, ръжено, овесено и ечемичено брашно. При правилно проведена диета диарията бързо спира и детето постепенно се възстановява. Лечението обаче продължава с години до пълното изчезване на непоносимостта към глутена. В някои случаи се налага тази строга диета да продължава цял живот.